2019年中起發生了社會事件，加上2020年農曆新年爆發的新冠肺炎，使學校經歷長時間停課，或無法進行面授課，除了影響學生的學習和社交活動外，連考試的安排也遭打亂。其中，每名小學生需要參加三次的呈分試便首當其衝，不但學校被逼重新編排試期，跨境生無法回校考試更是迫在眉睫的一大難題。
由於跨境生因疫情未能回校考試是前所未有的難題，沒有先例可援，雖然接獲會員求助，可是尋找合適的諮詢對象也非常困難，擬向內地學校商借校舍考試也不得要領。最後，幸得本會榮譽會長李莉女士在內地開設教授DSE課程的鯨帆DSE國際學校（深圳校區）（下稱「鯨帆」）的正面回應，表示可一起研究應變解決方案。
商討後，決定交由鯨帆為跨境生提供「一條龍」式的考試安排，由物色及佈置場地、處理試卷、現場及遙距監考、量體溫及粵康碼，到線上家長簡介會等一應俱全。合作雙方於2020年9月16日舉行「跨境學童考試委託儀式」，邀請了中聯辦新界工作部部長高級助理區劍偉局長蒞臨，與首批參加考試學校的校長，共同見證美事，也象徵考試工作正式揭幕。
透過本會協調，鯨帆於2020年9月21日至10月9日為小六學生舉行本應於五年級下學期進行的考試，合共有200名學生參加。鯨帆的老師們不惜犧牲國慶黃金周假期，竭力做好考試工作，表現出對跨境同學的關心，以及為香港教育付出的誠意，同時更開創了跨境呈分試的試驗先河。
為了給考試工作汲取更多經驗，隨後於10月12至16日為8所小學，共50名跨境生安排了補考；11月促成18所小學，共550多名小六學生舉行「異地同考」，之後於2021年3月，先導計劃亦擴展至「重災區」北區，37所學校，共1700多人參加了考試。這時候，坊間亦已陸續出現其他機構提供跨境生考試服務。本會有關跨境生考試、補考和「異地同考」四個先導計劃的歷史任務亦告完成。
